Seguro que la mayoría de la gente usa el bittorrent, y muchos el Azureus, el que creo que es el cliente de bittorrent más famoso que existe. Es muy bonito, tiene muchas opciones, y funciona en muchos sistemas. ¿Desventajas? Está programado en Java y eso es sinónimo de usar muchos recursos.
Por eso yo llevo bastante tiempo usando el cliente rtorrent, un cliente que funciona por linea de comandos (ncurses) y que unido a la aplicación screen, da mucho juego 
Su principal ventaja respecto al rendimiento es que está escrito en C++ y que usa directamente la pila de red. En conexiones de alta velocidad es capaz de dar una velocidad el triple que otros clientes de bittorrent habituales ^_^
Ante todo, para instalar el rtorrent, en un sistema debian: sudo apt-get install rtorrent y listo. Si no, pues a descargar desde aquí.
Si uno se molesta un momento en configurarlo como es debido (sólo lleva unos minutos, al igual que cualquier programa ^^), pues se obtienen muy buenos resultados y prácticamente sin afectar al rendimiento del sistema. Y para simplificar, os diré todos los pasos necesarios para dejarlo listo:
Una vez instalado, lo primero que tenemos que hacer es tener una carpetita dedicada al bittorrent. En mi caso es /media/Almacen/Bittorrent, y dentro de ella tengo dos carpetas más, torrents e incompletos. En la carpeta principal tendré los archivos descargados, en la carpeta torrents, los archivos .torrent, y en incompletos, los archivos temporales mientras se descarguen. Esto es muy útil ya que podemos saber cuando se terminan de bajar los archivos o no
Si ya tenemos preparada la estructura en nuestro disco duro para empezar a bajar, nos vamos a crear un archivo de configuración, llamado ~/.rtorrent.rc
Así que para ello usa tu editor de textos habitual, nano, vi, emacs, kedit, gedit… y ábrelo:
$ gedit ~/.rtorrent.rc &
Yo he añadido las siguientes lineas de configuración:
Para guardar mis archivos que se están bajando en la carpeta especificada:
directory = /media/Almacen/Bittorrent/incompletos
El rango de puertos que usará el torrent. Asegurarse de abrirlos en el router/firewall
port_range = 8000-8010
Cuando se completen los archivos, moverlos a la carpeta principal:
on_finished = move_complete,"execute=mv,-u,$d.get_base_path=,/media/Almacen/Bittorrent/ ;d.set_directory=/media/Almacen/Bittorrent/"
Limito la bajada desde las 10 de la mañana hasta la 1 de la noche a 30kb/s, pero le quito los límites por la noche:
schedule = throttle_1,01:00:00,24:00:00,download_rate=0
schedule = throttle_2,10:00:00,24:00:00,download_rate=30
Comprueba el directorio por nuevos archivos .torrent, reinicia los nuevos torrents copiados y para aquellos que hayan sido borrados:
schedule = watch_directory,10,10,load_start=~/media/Almacen/Bittorrent/torrents/*.torrent
schedule = tied_directory,10,10,start_tied=
schedule = untied_directory,10,10,close_untied=
Cuando haya menos de 100Mb de disco duro, para de descargar archivos
schedule = low_diskspace,5,60,close_low_diskspace=100M
Por cierto, teneis un archivo de configuración de ejemplo en /usr/share/doc/rtorrent/examples/rtorrent.rc con lo que podeis abrirlo, toquetearlo a vuestro gusto, y luego guardarlo en ~/.rtorrent.rc para que se cargue por defecto.
Además, el rtorrent ya acepta almacenamiento en sistema de ficheros NTFS (lo que hizo que un tiempo usase el Azureus… – ya no mas!)
Cambiando de tema, una pregunta que muchos se harán es… “Como el rtorrent es una aplicación de consola, ¿necesito tener una consola abierta y dedicada al rtorrent?” — No! Con screen, es posible dejar cualquier aplicación de consola en segundo plano 
Arrancar rtorrent:
$ screen rtorrent
Dentro del rtorrent, para dejarlo en segundo plano:
[Control + A] [Control + D]
Para retomar el rtorrent, desde una consola:
$ screen -r
De todas maneras, hay más detalles en las páginas de manual de screen
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