Hoy me he peleado con el mencoder del mplayer para poder convertir un archivo de audio.

El problema principal era que no dejaba procesar el archivo porque no tenía una parte de video. Así que tras indagar un poco vi que la solución era “engañar” al mencoder, poniendo un archivo inútil de video… que no se usará

mencoder -ovc frameno -oac mp3lame -lameopts cbr:br=128 -of rawaudio -o resultado.mp3 -audiofile entrada.amr dummyvideo.avi

Y sí, lo he usado para convertir un amr (los archivos de audio grabados con un movil) que es solo audio, no video como los 3gp, a mp3.